L'Agenzia del Territorio, ente pubblico non economico italiano che opera dal 1° gennaio 2001, nasce dalla riorganizzazione dell'amministrazione finanziaria avvenuta alla fine del secolo scorso, secondo quanto stabilito dal D.Lgs 300 del 1999; in particolare, l'Art. 57 istituì le cosiddette agenzie fiscali: agenzia delle entrate, agenzia delle dogane, agenzia del territorio e agenzia del demanio iniziarono a gestire le funzioni esercitate dai rispettivi dipartimenti, grazie al trasferimento dei relativi rapporti giuridici, poteri e competenze.
L'Art. 64, peraltro, assegnò all'agenzia la competenza per lo svolgimento dei servizi relativi al catasto, quelli geotopocartografici e quelli relativi alle conservatorie dei registri immobiliari, con il compito di costituire l'anagrafe dei beni immobiliari esistenti sul territorio nazionale: ai fini della semplificazione dei rapporti con gli utenti, infatti, era necessario lo sviluppo e l'integrazione fra i sistemi informativi attinenti alla funzione fiscale e quelli delle trascrizioni ed iscrizioni in materia di diritti sugli immobili; inoltre, fu prevista una stretta collaborazione con gli enti locali in modo da favorire lo sviluppo di un sistema integrato di conoscenze relative al territorio.
Dal 1° dicembre 2012, in base al D.L. 95 del luglio 2012 relativo alle disposizioni urgenti per la revisione della spesa pubblica, è stata incorporata dall'Agenzia delle Entrate; nel decennio di operatività, tuttavia, ha assicurato l'accesso alle banche dati catastale e ipotecaria sia alle pubbliche amministrazioni che ai privati cittadini, attuando quanto disposto dall'Art.59 comma 7-bis del Codice dell'Amministrazione Digitale.